气泡病
　　病因：此病多在水质不洁，强光照射或不及时换水，藻类大量繁殖情况时出现，尤其是雨后光线强时更易发生。病海马鱼体各处表皮隆起许多大小不等的气泡，影响正常生活，浮于水面，失去平衡，呼吸困难。最后气泡溃烂。细菌侵入，发生炎症；特别是长在吻部气泡能使海马呼吸闭塞雪生炎症而致死。
　　防治：保持水质清洁，避免强光直射；将病鱼移入新鲜水中及阴凉处；控制藻类繁殖，这样病情可逐渐好转。用针刺破气泡放出气体，能获得较好效果。用2.4‰的生石灰水浸浴病海马10分钟，或将病海马移至新鲜清洁海水中，加入0.1‰~0.2‰石灰浸浴消毒1次~2次，或用5ppm的高锰酸钾海水溶液浸洗5分钟~10分钟，或以1%~2%的漂白粉进行治疗，也有一定效果。不过，漂白粉易变质，故每次用药时需先进行安全测试。适用药物：生石灰、高锰酸钾、漂白粉。
　　胰脏炎
　　病因：病因不明。据解剖观察，发现胰脏组织发炎，呈微红色。主要是大海马感染此病。病鱼呼吸加速，孤独不食，痴呆呈昏迷状，1天~2天后即死亡。
　　防治：用磺胺脒药片研成粉末拌入饵料，加水泡浸5分钟~10分钟，然后投喂病海马，可获疗效。适用药物：磺胺脒。
　　胀鳔病
　　病因：海马的生活条件发生突然变化，如水温突然升降，光线太强，氧气充足，水质恶化，饵料不足等，均容易引起此病。此病多发生在海马仔至成鱼阶段，且雌性居多。病海马鳔囊充满气体，腹部胀大，不能下沉，游泳失常，只能侧卧漂浮于水面，摄食困难，时间过久鱼体消瘦，最后死亡。
　　防治：改善海马生活条件，保持水质清洁、新鲜、氧气充足，水温稳定，避免强光；供给优质饵料。
　　肠胃病
　　病因：此病是由于细菌感染而引起的，多发生在海马细苗阶段。得此病的海马肛门松弛、红肿，附有白色物。其肠胃胀大，轻压腹部有乳白色粘液流出。病海马行动痴呆、迟缓，漂浮于水面。食欲减退，鱼体消瘦衰弱致死。
　　防治：保持水质和饵料清洁，适当减少投饵量，能使病情减轻。用氯霉素、合霉素、青霉素、土霉素等抗生素防治也有效。使用方法是全池泼洒，每立方水体100~200万单位。2天~3天换水的同时下药一次，直至病态消除为止。此法用于预防效果更佳，做法是：从苗初生开始用药，坚持半个月，可提高成活率。适用药物：合霉素、青霉素、土霉素等抗生素。
　　肤毛病
　　病因：海马体表被水螅虫或种形虫等寄生。此病对海马苗危害较大。得此病的海马，鱼全呈“毛虫”状，常因身体负担过重，活动不便，焦躁不安，挣扎摆动，摄食困难，渐渐体弱致死。海马仔和成鱼患此病虽对其活动影响不大，但时间长而严重者常因引起的皮肤损烂、色素脱落，形成白斑，感染其他病菌而死亡。
　　防治：用1‰福尔马林（甲醛）溶液浸溶30分钟。
　　烂鳃病
　　病因：病原体是车轮虫，寄生在鳃部或体表，整年均有发生。此病虽不是严重病害，但在鳃部大量附生车轮虫，以引起鳃组织腐烂，妨碍海马呼吸，损伤鳃组织产生毒素，影响其生长，严重患者也会死亡。
　　防治：用8ppm硫酸铜和10ppm高锰酸钾溶液浸浴15分钟对车轮虫有杀死作用，效果显着。此外，用0.7ppm的硫酸铜和硫酸亚铁混合剂进行全池浸浴，每隔1天施放1次。适用药物：硫酸铜、高锰酸钾、硫酸亚铁。