立秋之后，天气渐凉，水温逐渐下降。此时仍适宜一些病原体的滋生与繁殖，所以仍是鱼病多发的高峰期。要继续做好鱼病的防治工作，决不能掉以轻心。一般在9月中下旬（水温降到20℃左右），最好做一次系统的鱼病检查，以确保鱼类安全越冬。其重点是防治细菌性、寄生虫鱼病和营养性疾病。
　　鱼病检查
　　取主养与配养鱼各2尾~3尾，按常规鱼病检查方法由表及里地进行目检和镜检。重点是检查细菌性和寄生虫性鱼病以及内脏脂肪集累、肝脏脂肪浸润等情况。以便掌握鱼体的健康状况，为设计系统鱼病预防方案提供依据。
　　秋季多见的鱼病主要有细菌性烂鳃病、竖鳞病、水霉病、打印病以及指环虫、三代虫、车轮虫、鱼虱等寄生性鱼病。
　　细菌性鱼病可根据发病部位、病鱼的症状，结合相应器官的病变情况加以确诊。寄生虫性鱼病可通过目检和镜检寄生虫的形态确诊。肝脏健康状况可通过目检肝的外表、大小、颜色，和镜检肝组织确诊。饲料中碳水化合物含量过高，除引起内脏脂肪大量集累外，肝脏大量积蓄肝糖，进而引起肝脏脂肪浸润，形成脂肪肝。病变的肝脏外观肿大，色泽变浅，外表有光泽。患脂肪肝的鱼体机能和健康水平下降。这往往是造成鱼类越冬死亡的内因，应引起高度重视。在越冬前必须加以药物治疗。
　　鱼病防治
　　根据鱼病系统检查结果，应先对已发现的鱼病进行治疗。治疗后要检查治疗效果，以确保鱼类无病害越冬。一般鱼病防治方法如下。
　　1.防治寄生虫性鱼病：驱虫，根据发现寄生虫的种类选药。如有原生动物寄生可选用硫酸铜和硫酸亚铁合剂（5∶2），浓度0.7ppm全池泼洒；如发现有蠕虫或甲壳动物寄生虫可选用敌百虫浓度0.5ppm全池泼洒，连用两次。选用的药物要注意对症。如果同时有两种以上的寄生虫寄生时，选一种药不能保证疗效。可以选两种药，分两次施用。
　　2.防治细菌性鱼病：杀菌，一般在没有发现细菌性鱼病的情况下，也应按常规进行一次杀菌消毒。如果发现有细菌性鱼病一定要在越冬前治愈。杀菌药物可选用漂白粉、强氯精等，用量按常规即可。如果发现有细菌性鱼病，可配合外消，再选用对症的口服药物拌饵投饵。直至痊愈。
　　3.防治脂肪肝：投药，在细菌性和寄生虫性鱼病的防治工作结束后，应投喂药饵，以透解郁热、疏肝理脾，改善肝功能，增强体质。一般轻度脂肪肝可在饲料中补加胆碱（每千克饲料中添加2.5克），中度脂肪肝除添加胆碱外，还应再补加肌醇（每千克饲料40毫克~100毫克）和维生素C（每千克饲料40毫克~60毫克）；重度脂肪肝最好不越冬，结冰前出池。如果必须越冬的话，可在饲料中添加中草药茵陈（千克饲料添加3.2克）、车前草（每千克饲料添加1.2克）、甘草（每千克饲料1.2克）制成药饵投喂，以缓解病情，防止肝病恶化。投喂中草药药饵时间应较长，最好喂到停食为止。