蔬菜真菌类病害有1000多种，常见的有200种左右。蔬菜病原真菌浸染力强，不但可通过伤口和自然孔口（如气孔等）侵入寄主，而且可通过表皮直接侵入寄主。因此，在蔬菜各个部位（根、茎、花、叶、果实）都可感染发病。真菌病害的识别与防治方法如下。
　　识别：
　　病斑有霉层，维管束变褐
　　识别蔬菜真菌性病害主要从以下两个方面着手：
　　病斑上有霉层病害部位出现病斑，空气湿度大时（如早晨），病斑上有病征出现，如粉层、霉层、黑色颗粒等。如黄瓜霜霉病，发病部位主要在叶片上，形成多角形病斑。潮湿时，在病斑处长出紫黑色霉层。
　　病株枯萎、黄萎枯萎病的病株表现为全株凋萎，根系腐烂，病株茎基部有粉红色霉层，剖开茎基部，维管束呈褐色。瓜类作物的枯萎病、黄萎病病株，病叶由黄变褐，并自下而上逐渐凋萎、脱落，剖开病株的根和主茎，维管束变褐。
　　防治：
　　消毒处理、合理轮作最有效
　　种子处理在播种前，对种子进行消毒处理，常用的方法有温汤浸种（用55℃~60℃的温水浸种20~30分钟）、日光暴晒、药剂浸种（用50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液浸种20分钟），浸种完毕后，用清水冲净，然后播种。棚内土壤处理由于连年种植，棚内土壤中土传病害如立枯病、枯萎病等病菌量较大。在播种前，结合整地对土壤进行消毒处理，能有效防止病害的发生。预防蔬菜苗期病害如立枯病、猝倒病时，可在播种前每平方米用五氯硝基苯5克与代森锌或福美双5克加细土15公斤，或用五氯硝基苯9克与拌种双7克加过筛细土4~5公斤，混匀配成药土，播种时，先将苗床浇足底水，然后将1/3药土填底，2/3药土覆种，出苗前，土壤半干半湿；预防蔬菜枯萎病、黄萎病时，播种前15天左右，在棚内每隔25~30厘米打一个20厘米深的小孔，向每个小孔内注入5毫升氯化苦溶液，立即盖土踏实，然后覆上薄膜，密闭15天后再揭膜翻土，让药液挥发后再播种。
　　大棚消毒处理在高温闷棚时，向棚内喷洒福尔马林100倍液或菌毒清300倍液，每亩喷洒40~50公斤，可有效杀灭棚内土壤及空气中的病菌和病毒。
　　加强温、湿度管理采取各种措施，合理控制棚内温、湿度，既有利于作物健壮生长，又能有效防止病害发生和蔓延。以早春大棚黄瓜栽培时的温、湿度管理为例，在日平均最低气温稳定在10℃~13℃时，棚内温、湿度管理分以下几个阶段进行：日出后，通过大棚温室效应，使棚内温度尽快升为28℃~30℃，上午10时左右，当棚内温度超过30℃时，通风散湿，使棚内空气湿度保持在60%~70%;下午，棚温最好保持在20℃~25℃，棚内湿度保持在60%左右，下午3时以后闭棚保温；日落后与前半夜，因棚内湿度随温度降低而增加，所以棚内应缓慢降温，以避免棚内湿度过大，棚温应保持在15℃~20℃，湿度控制在80%左右；后半夜，棚温保持在10℃~15℃，湿度保持在80%~85%.采取这种变温、变湿管理，既有利于黄瓜健壮生长，又抑制了病害的发生。为控制大棚内的湿度，常采用高垄地膜栽培，合理密植，大棚滴灌等措施，避免大水漫灌。
　　合理轮作大棚内最好能实行轮作，避免连作。轮作方式上，水旱轮作效果最好，枯萎病重的大棚尽量不要种植瓜类和茄科作物。
　　嫁接防病利用抗病砧木嫁接栽培，可以预防多种病害，并有明显的增产效果，比如黄瓜用南瓜砧木进行嫁接，是防治黄瓜枯萎病的最有效方法。
　　药剂防治防治真菌病害的药剂较多，但应注意选用高效、低毒、无残留的杀菌剂。