斑点叉尾鮰对四种药物的敏感顺序依次为敌百虫＞硫酸铜＞甲醛＞食盐。敌百虫不宜作为饲养斑点叉尾鮰时全池遍洒的治疗药物。高锰酸钾亦不宜作为斑点叉尾鮰的浸洗药物。虽然斑点叉尾鮰的抵抗力强，疾病少，但管理不善也会导致水霉病、孢子虫病、烂鳃病等发生。尤其是早春，鱼体受伤后易患水霉病，因此操作时应小心谨慎，避免鱼体受伤，并注意预防。斑点叉尾鮰几种常见疾病的治疗方法如下：
　　1、水霉病
　　①用3％～4％的食盐水浸洗5min；或用0.5％～0.6％的食盐水浸洗1h以上；
　　②在密网箱内，用浓度各为0.04％的食盐和小苏打溶液，浸洗2～4d。
　　2、孢子虫病
　　目前尚无有效的治疗方法，要注意预防。每亩用150kg生石灰清塘效果较好。
　　3、烂鳃病
　　①用0.03mg/L的呋喃西林全池遍洒，效果较好；
　　②每100千克鱼用呋喃西林35g制成药饵投喂，6d为一个疗程。
　　4、三代虫病
　　①用25mg/L的甲醛溶液药浴；
　　②用0.5～0.7mg/L硫酸铜溶液药浴。
　　5、车轮虫病
　　①0.8mg/L的硫酸铜、硫酸亚铁(5：2)合剂全池遍洒，15min后注入新水；
　　②用25mg/L的甲醛溶液药浴30min。
　　6、肠炎病
　　每50kg鱼用呋喃西林粉剂2g拌饲料投喂，连续3d即可治愈。