胡萝卜黑斑病是全国性主要病害之一。种株发病，造成减产和质量低劣。
　　症状识别、叶柄、茎上发病。叶片多从叶尖或叶缘发病，产生褐色小病斑，有黄色晕圈。扩大后呈不规则形黑褐色，内部淡褐色病斑，布满叶片后叶缘上卷，从下部枯黄。潮湿时，病斑上密生黑霉（分生孢子）。茎、花梗发病，产生长圆形黑褐色稍凹陷病斑，易此折断，种子不饱满，并带病菌。
　　发生原因：由胡萝卜链格孢引起。病菌在种子和病残体上越冬。种子带菌率高，引起苗立枯。第二年新斑上长出的孢子借气流传播，从气孔、伤口或表皮直接侵入。
　　发病条件：发病适温28℃左右，15℃以下或35℃以上不发病。南方在7、8月发病。缺肥、生长势弱发病加重。
　　防治方法：1、种子用0.3%的50%扑海因可湿性粉剂，或50%福美双可湿性粉剂，40%拌种双拌种后播种。2、实行2年轮作。3、增施基肥和追肥。4、发病初期喷洒50%扑海因可湿性粉剂1500倍液，或75%百菌清可湿性粉剂600倍液、70%代森锰锌可湿性粉剂600倍液，隔7～10天1次，连续防治2～3次。
　　胡萝卜斑点病
　　胡萝卜斑点病是胡萝卜上常见病害，夏秋高温期时有流行。种株发病，影响种子产量和质量。
　　症状识别：叶、叶柄及茎上发病。嫩叶初生圆形或近圆形2～4毫米褐色病斑，扩大呈纺锤形或多角形，中央灰褐色，边缘稍隆起。潮湿时，正背面均有灰色霉。发生严重时病斑连结成片，从下部叶枯死。叶柄、茎部均产生褐色凹陷病斑。此病在病斑上生灰色老，可与黑斑病区别。在田间，往往与黑斑病混发。
　　发生原因由胡萝卜尾孢菌引起。病菌在种子内外、地表病残体上越冬。翌年产生孢子借风雨传播。
　　发病条件：夏季高温时期发生。前期缺肥干旱，植株生长弱，此后遇雨、大雾或排水不良等发病重。
　　防治方法：与胡萝卜黑斑病同，见该项。
　　胡萝卜软腐病
　　胡萝卜软腐病又称腐烂病，是常见病害，南方发生多。种株发病重。
　　症状识别：主要为害肉质根。田间慢性发病，先部分叶黄化后萎蔫。急性发病，则整株突然萎蔫青枯。检查病株，根茎部呈水浸状软化，肉质部变灰褐色软化腐烂，外溢汁液发恶臭。
　　发生原因由胡萝卜软腐欧氏杆菌引起，与白菜软腐病同。
　　发病条件：病菌从自然伤口、机械伤口、虫伤等处侵入。伤口往往是长期干旱后下大雨、遇暴风雨、中耕松土以及地下、地上害虫为害等造成。在夏秋高温多雨、排水不良地发病重。
　　防治方法：1实行与大田作物轮作2年，或水旱轮作。2、高畦直播栽培，不宜过密，通风好，加强排水，3、及早防治地上、地下害虫。4、发病后适当控制浇水。5、发现病株拔除处理。6、发病初期喷洒72%农用硫酸链霉素可深性粉剂4000倍液，或14%络氨铜水剂300倍液，丰灵200倍液，隔7～10天1次，共喷2次。