当前，尽管有关植物提取物对植物病原菌抗菌活性的研究较杀虫活性的研究少得多，但是，植物仍被认为是化学合成杀菌剂替代品最好的开发资源。植物源杀菌剂是利用有些植物里含有的某些抗菌物质或诱导产生的植物防卫素，杀死或有效抑制某些病原菌的生长发育。杀菌剂的种类很多，按照它的作用方式可分为三类。

　　1、植物保护剂  春天的时候，我们会经常看到园丁在树干的底部涂上一层白色的物质，这就是保护剂的一种波尔多液。这类药剂分布在植物体的表面后会形成一层药膜，病原微生物接触到药膜后会被杀死，保护植物免受其害。这类保护剂除了波尔多液外，还有代森锌、百菌清等。这种杀菌剂由于对植物体的副作用小，得到了广泛的应用。

　　2、植物治疗剂如果病原微生物已经浸入植物体内，但植物表现病症处于潜伏期。这时就要使用治疗剂了。使用治疗剂后，药物从植物表皮渗入植物组织内部，经输导、扩散、或产生代谢物来杀死或抑制病原，使病株不再受害，并恢复健康。具有这种治疗作用的药剂主要有多菌灵、托布津、春雷霉素等。

　　3、植物铲除剂指植物感病后能直接杀死已侵入植物的病原物的药剂。这是一种强力杀菌剂。但不能用于生长期间的花卉，如果在植物的生长期用铲除剂会对植物造成一定的伤害。铲除剂适用于铲除休眠期间花卉表面的病原菌，同时，对土壤也有消毒作用。这类药剂常用的有石硫合剂、福美砷、五氯酚钠、石硫合剂等。