福尔马林是甲醛的水溶液，是蛋白质凝固剂，会使鱼的黏液、表皮蛋白质凝固，因此，泼洒浓度过高，对鱼的鳃、体表均有危害。其药效与使用时的温度、环境有关，水温在23℃～26℃时，48小时最大安全浓度为56PPm，一般实际使用时泼洒30PPm对鳗鱼是无害的，但水温在28℃以上时，药效对池水中浮游生物有杀灭作用，容易引起水质变坏。
    从实际应用来看，使用福尔马林弊大于利，请看：
　　1、福尔马林在鳗鱼养殖中的应用养鳗大发展时期，许多养殖户都喜欢用呋喃唑酮（痢特灵）加福尔马林来治疗鳗鱼的烂鳃病，有的甚至还把它当作"绝招"来使用。初时使用效果很好，但慢慢就不行了，到后来就是谁使用得越多，谁的鳗鱼就死得越多。这是因为福尔马林对池水中的浮游生物有极强的杀灭作用，引起水质变坏，鳗鱼的摄食变得差，影响了鳗鱼的生长，导致死鳗的增多。实际上，单独使用呋喃唑酮或呋喃西林来治疗鳗鱼的烂鳃病效果就已很好，无需再加福尔马林。
　　2、福尔马林在加州鲈、生鱼、桂花鱼养殖中的应用不少养殖户在生鱼、加州鲈、桂花鱼等鱼塘中使用福尔马林，造成鱼类突眼、瘦身、摄食不良、生长速度减慢等现象。虽然福尔马林对杀灭车轮虫和斜管虫效果确实不错，但其副作用也是相当大的，因为它有腐蚀作用，能致鱼鳃组织发炎，再加上其它消毒药物对鱼鳃的刺激，往往会使桂花鱼等产生暴发性传染病（即白鳃病），一不小心，就会全塘死光。