微生物农药对人畜没有危害，而且不易产生抗药性，因而深受人们的推崇，但是对于任何事物而言，有利就有弊，微生物农药也是如此，那么微生物农药的缺点有哪些呢?又该如何科学的使用微生物农药呢?
　　微生物农药的优点
　　大多数微生物农药为低毒或微毒，不易对使用者产生毒害;有利于农产品质量安全，污染小，不会破坏生态平衡;不易产生抗药性。
　　微生物农药的缺点
　　微生物农药一般只对一种害虫起作用，对其它害虫完全没有作用;对温湿度要求较高，微生物源农药使用的适宜温度在15-30℃;对紫外线敏感，紫外线对微生物源农药有致命的杀伤作用;是药效较慢，用药后病虫害不会立即见效，施药时间应较化学农药提前2-3天等。
　　微生物农药正确使用规范：
　　一、避开低温时段使用微生物农药
　　试验表明在25℃-30℃之间喷施后的微生物活体农药防治效果要比在10℃-15℃之间的高出1到2倍。
　　二、空气湿度要大
　　如晴天上午10点钟到下午4点钟前等高温干燥的天气条件下施用效果不佳。因此最好选择阴天、雨后或早晨等湿度大时施用。
　　三、大雨冲刷会减低药效
　　暴雨会将喷施的菌液冲刷掉。如果喷施5-6小时后遇到小雨不但不会降低药效反而可提高防效作用因为小雨对芽孢发芽大为有利害虫一旦食后会加速其死亡。所以要根据天气预报确定施用时间。
　　四、避开太阳光
　　没有避开高温、强太阳光的中午施用引起药效下降。微生物活体农药最怕强太阳光照射。太阳光中的紫外线对芽孢有着致命的杀伤作用而且紫外线的辐射对伴孢晶体还能产生变形降效作用因此要选择在下午4点钟以后或者阴天使用效果会大大发挥。
　　五、避免与杀菌剂混用
　　如块状耳霉菌作为一种真菌杀虫剂药效是通过块状耳霉菌的活孢子作用来实现的。施用后活孢子侵染蚜虫并致死可持续传染引起群体大量死亡。但作为一种活体真菌如果与杀虫剂混用它们被杀菌剂致死自然失去杀虫作用。
　　常用微生物农药推荐：
　　Bt乳剂，青虫菌和杀螟杆菌，白僵菌，井冈霉素，农用抗菌素和植物抗菌。