马铃薯是无性繁殖作物，许多病害极易感染马铃薯并通过块茎世代传递并累积，扩大危害，使良种变为劣种，从而失去种用价值。因此，为了防止或减轻马铃薯生产中出现的种性退化问题，采取合适的选留种措施是十分必要的。
1．留种方式
　　(1)高山留种
　　在各地选择海拔高、气候冷凉，风速较大的山地进行留种，可以减少薯块内病毒的含量。
　　(2)秋薯春播
　　将在秋季冷凉条件下生产、带病毒较少的择优薯块，作为第二年春薯生产用种。
　　(3)保护地冬播留种
　　利用温床或冷床在头年10月下旬至11月进行马铃薯冬播，将马铃薯的结薯时间调整到春季温度比较低的时间内，利用这些小薯块作为来年秋播的种薯，后代长势整齐、退化轻、产量高而稳定。
　　(4)从科研单位购买脱毒苗或微型薯原原种进行自繁原种和一代种薯。
　　(5)利用实生种子生产种薯
　　马钤薯实生种子具有摒弃若干病毒的作用，因此利用实生种子生产种薯可以大大降低种性退化问题。
2．留种技术
　　马铃薯留种除要求更严格的地块选择，肥水管理条件外，还应在以下几方面加以注意。
　　(1)去杂去劣
　　在马铃薯整个生育期中一般要进行3次去劣去杂。第一次是在出苗后半个月，将卷叶、皱缩花叶、矮生、束顶等病株拔除，这次病株拔除是至关重要的，因该阶段幼苗最易感病，早拔除病株可以早消灭毒源，防止扩大浸染。第二次是在开花期拔除田间退化株、病株及花色、株型不同的杂株。第三次是在收获前将植株矮小或早期枯死的病株拔除，连病薯、劣薯以及不符合本品种特征特性的杂薯一起运走。
　　(2)单株混合选择
　　单株混合选择也称集团选，选符合该品种特征的性状，生长健壮，无退化现象的是植株，做上标记，在生育期复查1～2次，发现植株出现异常的将标记去除。在收获时进行地下部块茎选择，选结薯集中、薯块大小整齐、薯皮光滑的单株。单株选、单株收，混合保存，作为下季种子田用种。
　　(3)单株系选
　　单株系选也称株系选、系统选。因同一马铃薯品种单株间染病情况不同，从而在产量上表现较大差异。通过单株选择，单株保存，株系比较，选优去劣，优中选优，优系扩大繁殖，经过 4～6代的对比选优及繁殖，可选出高产、退化轻、种性好、无病的株系。该方法既防止了退化，病害，又进行了品种复壮。其具体办法是：第一年进行单株选择，其方法与前述的单株混选相同。将收获的单株块茎分别装袋贮藏。第二年进行株系比较，连续进行2～3代比较。每个人选单株块茎种10～20株，形成一个株系 (最好用整薯播种)。生育期间经常观察，淘汰感病株系，选择高产、生长整齐一致、无“退化”症状的株系作为下一代的人选优良株系。第三年或第四年将选得的优良株系块茎扩繁后作种薯。
　　(4)严格病虫防治，及早收获
　　留种地加强植株病虫防治，力争不出病株或少出病株。及早防蚜，避免病毒传播。在保证适当产量的前提下较商品输提早收获20天左右，避免种薯受到高温或低温危害。