棉花营养钵育苗须做好五防。
    一、防空钵：棉种质量差、播种质量低、苗床管理不善等，都会造成空钵缺苗。预防措施：播种前除去烂籽、嫩籽，选晴天晒种2～3天。播种时做到钵湿、种湿。土钵摆好后浇水，一次性浇透，结合药剂浸种，让种子吸足水分。每钵播种1～2粒，播种后盖 1～1.5厘米沙土。盖籽沙土要求细而湿润，为种子发芽出土创造湿润疏松的环境。 
    二、防烧苗：出苗后，晴天不注意及时通风，易引起高温烧苗，严重时棉苗还会被烫死，造成缺苗。预防措施：抓好揭膜通风降温措施，防止晴天中午前后出现极端高温危害棉苗。出苗后床温宜保持在25℃~30℃。 
    三、防寒害：揭膜后如不注意及时盖膜，气温急剧下降，易使棉苗受寒，通风口上的棉苗更易受寒甚至受冻。预防措施：在棉苗出土后到３叶期前，根据气温的变化揭开两头通风炼苗，阴天则无须揭膜。平均气温16℃～18℃时，可进行日揭夜盖炼苗，一般于上午9时揭膜，下午5时重新盖膜。 
    四、防线苗：营养钵幼苗在膜内高温高湿的环境条件下，生长速度快，如管理不当就会旺长成为线苗，达不到壮苗要求。预防措施：一是出苗后及时间苗，每钵留壮苗１株，防止拥挤窜长。二是通风炼苗。适时适度降温降湿，减缓幼苗生长速度。三是使用壮苗素。在子叶平展至分心期，选择晴天中午用壮苗素250倍（或调节胺、助壮素 4000～5000倍）药液喷洒棉苗一次，待药液干后再覆膜保温，具有显著的壮苗效果。四是搬钵蹲苗。在第一片真叶展开时搬钵１次，降低温度和湿度，抑制旺长，促进侧根发育。如棉苗有旺长趋势，可增加搬钵次数，适当控制肥水，以控制疯长。 
    五、防病害：棉花幼苗主要病害是炭疽病和立枯病。如防治不力，将造成大量死苗。预防措施：首先要搞好营养钵土、盖籽土和种子的消毒工作。营养钵和盖籽土，用20%的稻脚青可湿性粉剂配成 0.3%～0.4%的药液消毒。种子最好选用包衣精选良种。如自留种子要进行消毒处理，每５公斤棉种可用25%多菌灵可湿性粉剂50克或20%稻脚青可湿性粉剂40～50克拌种。当子叶平展转绿后，抢晴天喷洒１次20%绿乳铜乳油600倍液，防炭疽病。以后每隔7～8天喷１次0.3%的稻脚青或多菌灵药液，防治立枯病。棉苗出土后，用20%络氨铜400倍液喷洒，以后每隔5～7天喷施1次，连续喷2～3次。在喷药时配喷0.3%的磷酸二氢钾液，具有良好的保苗健苗作用。