1、看整齐度：混有其它稻谷的杂交种子粒型不整齐，如混入的父本或其它籼稻谷粒，明显比杂交种子细长饱满，粳稻谷粒较圆。
　　2、看谷壳色鉴别：杂交种谷壳上略带不均匀的黄褐色等生理性杂色，而父本、保持系等谷粒颜色较为一致。保持系和其它杂株谷粒比杂交种子透明度高，谷壳比杂交种光滑。
　　3、水分鉴别：用牙咬，谷粒有破碎声，这时种子的含水量一般在13%左右；若无破碎声或谷粒断面不齐，这时种子的含水量一般高于13%。
　　4、净度鉴别：一般目测种子时无土粒、砂粒，用手插入种子堆或种子袋内，抽出时指缝和手背上没有灰尘等杂质，这时种子的净度一般在97%左右。
　　5、发芽率鉴别：随机取200粒种子，在30°C的温水里浸种24小时，6小时内换一次水，种子浸好后，用100°C开水将纱布袋消毒好，冷却后，把 100粒种子放在袋里用绒带系紧吊在开水瓶里，种子不能浸泡在水里，但是要接近水面。开水瓶里的温度要保持在25-30°C之间，5-7天内可以看发芽率。判断标准是，根长一粒谷长，芽长半粒谷长。一般种子发芽率不得低于90%。
　　6、陈种子鉴别：凡种皮色泽鲜、壳黄，种胚充实丰满，挖胚时，湿润带绿色，这类种子为生活力高的新种；反之，种皮色泽暗淡，种皮暗褐干秕，这类种子为生活力弱的种子。
凡新种中均无虫蛀的空壳、虫屎（蛀粉）和虫衣等现象，而陈种中则带有大量的谷壳、虫蛀的破谷和虫衣等迹象，而且陈种比重比新种低。