一、注意选择药剂的剂型 药剂应选择能融于水的药剂剂型有可湿性粉剂、水剂、乳剂和悬胶剂。不能用粉剂浸种，因为粉剂不溶于水，而是浮于水面或下沉，种子沾药不均，达不到浸种灭菌的效果。
二、药液的浓度要准确 浸种所用的药剂浓度一般是按照药剂的有效成份含量计算的。浸种的药剂浓度一般与浸种时间有关，浓度低浸种时间可略长一点，浓度高浸种时间要短些，如果不掌握好准确浓度，就容易发生药害或降低浸种效果。
三、掌握浸种时间 药剂浸种有一定的时间要求，过长会产生药害，过短达不到消毒目的。具体浸种时间要依照药品使用说明进行操作。
四、浸后的种子要冲洗和晾晒 对药剂忍受力差的种子，在浸过后，应按要求用水冲洗，以免发生药害。如果没有具体说明浸后要水洗，就不必水洗。不论需要还是不需要水洗，浸后都应摊开晾干，有的也可以浸后直接播种，应依农药种类和土壤墒情而定。
五、药液面要高出种子 在浸种时，药液要高出种子16厘米以上，以免种子吸水膨胀后露出药液面，降低浸种效果。
六、充分搅拌 种子放入药液中要充分搅拌，排除药液的气泡，使种子与药液充分接触，提高浸种效果。