鸡呼吸道疾病多以呼吸道复合征的形式出现，所谓呼吸道复合征是鸡毒支原体、大肠杆菌等病原和各种呼吸道病毒及不良环境协同作用的结果。
要防止呼吸道疾病的发生，首先要将病毒性呼吸道病例如新城疫、禽流感、传染性支气管炎、传染性喉气管炎等控制好，主要是做好这些病的免疫，防止这些病的发生，在免疫时尽可能减少应激反应。

如果发生了病毒性呼吸道疾病，遇到不良环境，很容易并发或继发鸡毒支原体病或鸡大肠杆菌病，使呼吸道病变得复杂化，防治起来十分困难。因此，要有效地控制呼吸道疾病发生必须控制好鸡毒支原体病和鸡大肠杆菌病。鸡大肠杆菌病的防治前面已谈过，鸡毒支原体病防治起来比较复杂。一般鸡群鸡毒支原体的感染率较高，要想彻底清除鸡毒支原体病的困扰，首先要净化种鸡群。对于一般的种鸡和商品鸡，早期用敏感药物控制感染非常必要，如果不注意预防早期感染，等鸡群已经感染发病，气囊已出现病变，此时再用药治疗，什么药也难以奏效了。

对种鸡群净化支原体病的方法很多，比较切实有效的方法是在做好综合防疫的前提下，用鸡毒支原体疫苗免疫鸡群。灭活苗能有效地阻断鸡毒支原体经蛋传递，但不能保护被免鸡群免受感染；f株是一种弱毒苗，不仅有阻断鸡毒支原体经蛋传递的作用，还能对被免鸡群起到保护作用，一个场里坚持用此苗连续免疫2-3年，鸡群中的野毒就会被f株置换，我们再用6／85等弱毒苗免疫鸡群，鸡场的鸡毒支原体病就会得到净化。

鸡群的呼吸道疾病往往与鸡舍的环境好坏有着密切关系，如空气中的粉尘、氨气的含量也都对呼吸道病的发生有密切关系。因此，鸡舍适当的通风，采取措施减少鸡舍中氨气的产生，对减少呼吸道疾病的发生也是十分必要的。