近年来，多数苹果产区都采用苹果套袋技术，收到了预期效果。但由于近几年气候的异常变化和果农应用套袋技术水平的差异，使套袋苹果出现了诸多问题。现将原因总结如下，以供广大果农参考。
　　套袋苹果裂纹重的原因
　　一、苹果"肩部"裂纹重的原因在苹果生长后期，当果肉细胞仍在继续膨大时，如果此时温度下降，果皮就会收缩，而仍在继续膨大的果肉细胞则会撑开果皮，导致果皮出现裂纹。苹果的"肩部"由于果皮嫩所以裂纹重。
　　二、苹果梗洼裂纹重的原因
　　摘袋不及时或苹果采收不及时，梗洼裂纹皆会加重。如嘎拉苹果，摘袋后7天没有采收，20%以上苹果将产生裂纹。
　　另外，降雨多，苹果裂纹重；摘袋后，如果每天有露水且上午11时之前果面不干，苹果裂纹重；地下湿度大，苹果裂纹重；气温不稳定，苹果裂纹重；7-8月偏施氮肥的苹果园，苹果裂纹既多又重。
　　套袋苹果萎缩不长的原因
　　一、原因长期干旱缺水、树势弱的苹果园和透风透气性差、温度高、湿度小的苹果园，易出现套袋后苹果萎缩不长的现象。尤其是外层较厚而耐雨淋、内层为非压光黑纸的双层纸袋，平日袋内无湿气，高温天气时袋内温度高达50℃，苹果内水分倒流到叶片中，引起苹果生长停止、甚至萎缩。
　　二、防治技术（一）及时浇水。对贫瘠地、山坡地、高原地的套袋苹果园，干旱年份应及时浇水。（二）避免使用紫、红色的塑料膜袋和内层为非压光黑纸的双层纸袋。（三）加强苹果园管理。合理负载，使苹果园通风透光，不提倡过度环剥。
　　套袋苹果为何发黄不上色
　　一、氮肥施用过量尤其是在7-8月，冲施氮肥过多或地下追施氮肥过多，都会出现摘袋后苹果发黄不上色的现象。
　　二、硼中毒如果追施硼砂过多会导致硼中毒，使苹果发黄不上色，而且一旦出现这种情况，可能连续3年苹果着色困难。
　　三、环剥过重苹果早期落叶严重，树体营养积累不足，在这种情况下，不少果农仍继续加大环剥力度，结果导致不少苹果园出现苹果发黄不上色的现象。
　　四、持续高温连续5天超过30℃以上高温天气，套袋苹果袋内温度超过60℃，由此影响了着色物质的形成。
　　五、摘袋时间套袋苹果要适时采摘，若摘袋过早苹果会先着色后退色，返为绿色，出现"绿腔"现象。