大多数农药为有机化合物和无机化合物，其物理性能和化学性能因药而异，比较复杂。因此，各种农药必须要专门妥善保管，在保管过程中，要注意以下问题。 
1、存放农药的地点，离粮仓、饲料房、牲畜棚圈要尽可能远一些，防止污染和相互影响，也不宜与化肥同放。
2、存放时的温度。其温度不能过高过低，一般在30℃以上的温度条件下，温度越高，农药越容易融化、分解、挥发，甚至燃烧爆炸；温度太低对农药也有不利的影响，如有些液体农药，在0℃以下就会结冰，使药效降低。
3、存放农药地点要干燥。如可湿性粉剂等，很易吸潮，吸湿后变成粗壮或硬块，一来施用的时候比较费事，二来会变质失效纸袋包装的农药受潮后容易破裂，不仅不好搬运，还会污染周围环境
4、农药长时间暴露在空气中和阳光下，容易挥发和发生氧化作用等，引起质变。一般固体农药要包装严密，液体农药要用有色瓶子或罐子盛装。不管是固体还是液体农药，都不能直接放在阳光下曝晒。 
5、药库或药箱要远离火源，尤其是瓶装农药要严密封口，防止毒气挥发、燃烧和引起人畜中毒等。