但因药材直接影响病人健康，所以在肥料的选择上应该十分谨慎，最好以有机肥和生物肥为主。
一、海藻生物菌肥是首选。
海藻肥是当今世界先进肥料的代表，在抗逆性、天然活性和无毒、无污染等方面比化学肥料具有不可比拟的优势。金宝贝海藻生物菌肥是在海藻肥的基础上加入大量有效菌种，利用微生物的分解作用，活化土壤以及进行生物固氮解磷、解钾。它是从澳大利亚原装进口，系采用当今国际最新微生物工程技术和工艺手段，从海洋生物中分离、提纯，经精工研制而成的一种营养成分全面、高效、无毒无害、无污染的纯天然高浓缩广谱型最新一代液体微生物肥料，是生产中药材的首选肥料。
二、中药材种类和适宜追施的肥料。
1、根茎及根类如丹参、白术、附子、半夏等，叶面追肥以磷钾肥为主。可用0.4%磷酸二氢钾或2%过磷酸钙浸出液、4%草木灰浸出液对水喷施。喷施时间一般在生长中后期。
2、果实籽仁类如牛蒡子、薏苡仁等，叶面追肥以氮、磷、钾混合液或多元复合肥为主。用1%尿素加2%过磷酸钙浸出液加1%硫酸钾混合液，或用浓度0.2%～0.3%磷酸二氢钾喷施。一般在生长中后期喷施1～2次效果较好。
3、全草及花类如薄荷、菊花、红花、番红花等，叶面追肥常用浓度为1%～2%的尿素，每亩喷施量50kg～60kg，整个生长期喷1～3次。
三、中草药叶面追肥应注意的事项。
1、施用的时间要适宜。叶面追肥一般在晴天的上午进行，雨天不能喷施。喷后3小时内遇雨，天晴后应补喷，但浓度要适当降低。
2、肥料的浓度要适宜。追肥浓度过大时，不仅会增加成本，还会发生肥害，造成损失。特别是在施用微肥时，应特别注意。
3、肥料要合理施用。喷施过磷酸钙等含磷肥料，要经过浸泡24小时后取其上清液。