炭疽病是辣椒上的常发病害，特别是在高温季节，果实受灼伤，易并发炭疽病，使果实失去商品价值。
　　炭疽病主要危害辣椒果实和老叶，也可侵染茎部。果实染病，初现水渍状黄褐色圆斑，扩大后边缘褐色，中央灰褐色，病斑有隆起的同心轮纹，由许多黑色或橙红色的小点集成。潮湿时病斑表面溢出红色黏稠物，被害果内半软腐，易干缩。叶片染病，产生近圆形褐斑，中间灰褐色，后期产生轮状排列的黑色小粒点，严重时导致落叶。茎和果梗染病，出现不规则短条形凹陷褐斑，干燥时表皮易破裂。
　　辣椒炭疽病由半知菌亚门真菌侵染引起，病菌以分生孢子附着在种子表面或以菌丝潜伏在种子内越冬，播种带菌种子会引起幼苗发病。病菌还能以菌丝或分生孢子盘随病残体在土壤中越冬，成为下一季的初侵染源。越冬后长出的分生孢子萌发长出芽管，从寄主表皮的伤口侵入，发病后长出大量分生孢子进行再侵染。高温高湿环境有利于发病，地势低洼、土质黏重、通透性差、施肥不足或氮肥过多、管理粗放造成伤口、果实受暴晒等，都会加重病情。
　　防治辣椒炭疽病，应实行综合防治措施。播前翻晒土壤，减少初浸染源；选用无病种子，用50℃的热水浸种20分钟；合理密植，使辣椒封行后行间不郁蔽，果实不暴露；适当增施磷钾肥；防止田间积水；及时采果；发现病果立即摘除带出田外销毁；重病田与瓜类和豆类蔬菜轮作2～3年。发病初期，用50%多菌灵可湿性粉剂或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液喷雾防治。保护地栽培可以每亩用45%百菌清烟剂250克熏蒸防治。