微生物杀虫剂是利用微生物的活体制成的。在自然界，存在着许多对害虫有致病作用的微生物，利用这种致病性来防治害虫是一种有效的生物防治方法。从这些病原微生物中筛选出施用方便、药效稳定、对人畜和环境安全的菌种，进行工业规模的生产开发，从而制成微生物杀虫剂。

　　微生物杀虫剂主要可分为真菌、细菌和病毒三类。在其他微生物中，放线菌一般利用其代谢产物抗生素，而不直接利用其活体作杀虫剂。原生动物、线虫和立克次氏体等微生物的利用研究得很少，尚未实用化。

　　真菌杀虫剂

    已发现的昆虫病原真菌约750种寄生范围很广，但开发成杀虫剂的不多，已试验成功并有一定规模应用的有：利用白僵菌防治马铃薯甲虫、大豆食心虫、松毛虫和玉米螟；利用绿僵菌防治金龟子、孑孓；利用汤普森多毛菌防治柑橘锈螨；利用轮枝孢防治温室蚜虫；利用座壳孢防治粉虱和介壳虫等。

　　细菌杀虫剂

    微生物杀虫剂中研究开发最成功的是利用芽孢杆菌作杀虫剂，主要品种为苏云金杆菌，已广泛应用于农作物、森林、粮仓和蚊蝇等的防治。苏云金杆菌发现于20世纪初，30年代开始实用化，50年代即有工业生产，70年代以来发展较快，80年代全世界年销售额超过2000万美元。中国在70年代已大量生产，有青虫菌、杀螟杆菌等许多商品名称。苏云金杆菌有很多变种，其芽孢内含毒蛋白晶体，通称δ-内毒素是杀虫的主要成分。当孢子进入害虫消化道后毒素被活化使害虫麻痹瘫痪而死。由于各变种所含蛋白晶体的结构不同，其毒力和适用的害虫对象也不同。例如应用较广的寇氏变种用于防治鳞翅目幼虫;以色列变种用于防治孑孓。其他已开发利用的细菌杀虫剂还有日本甲虫芽孢杆菌，用于防治金龟子幼虫颇有效。

　　病毒杀虫剂

    寄生于农业害虫的病毒已发现约 200种，有些已被开发作为病毒杀虫剂。其中大多数属于杆状病毒的核多角体病毒，少数是颗粒体病毒。昆虫病毒有高度的专一寄生性通常一种病毒只侵染一种昆虫而对他种昆虫和人无害，因此不干扰生态环境。但由于病毒只能用害虫活体培养增殖，使大规模工业生产受到限制。已经小规模商品化的病毒杀虫剂多数用于防治鳞翅目害虫，例如棉铃虫、舞毒蛾、斜纹夜蛾、天幕毛虫、菜粉蝶等。中国在80年代已广泛试验推广病毒杀虫剂。