种子入库后，无论是长期贮藏，还是短期存放，都需要在适当的时候进行通风。科学的通风管理，可调节仓内温度，降低湿度，保持种子干燥，进而抑制仓储期间种子生理活动的进行和害虫、霉菌发生为害，使之不降低原有种性和价值。在仓贮期间要注意以下几方面问题：
　　1、种袋摆放要科学麻袋包装的种子应采用“非”字或半“非”字型堆放法。禾谷类种子堆高为8～10包，油料种子7包以下，种堆方向与门窗平行，便于通风降温。
　　2、认真查记温、湿度库房须配备温度计、湿度计和曲柄温度计等仪器，确定专人做好仓内外渐、湿度和种堆温度的测试工作。坚持2～3天测一次，并做好记录，为及时通风提供依据。
　　3、通风时应注意的几个问题
　　（1）当仓内的温度和相对湿度均高于仓外时，应及时通风，降温排湿。当仓内温度等于仓外，相对湿度高于仓外时，或仓内相对湿度等于仓外、温度高于仓外时，也要进行通风。
　　（2）如仓外温度高于仓内，相对湿度低于或等于仓内时不宜通风，否则容易引起表面层种子结露。
　　（3）若仓外温度低于仓内，相对湿度高于仓内，通风与否要看当时的绝对湿度，即仓外绝对湿度低于仓内时，可以通风，反之不能通风。
　　（4）一天当中，最低温（这时相对湿度较高）、最高温出现时不可通风。以上午7～9时，下午5～8时通风为宜。
　　（5）一年当中，雨季到来时不能通风，气温上升阶段（5～8月份）避免通风，以尽量保持种子原有干燥程度和低温状态。气温下降阶段（9月至第二年2月份）可以逐步通风，以降低种温和仓内湿度。