真菌性病害又可以称之为非侵染性病害，如炭疽病、灰霉病、白粉病等，导致农作物产生真菌性病害的因素有很多，最主要的原因是土壤和气候条件不适宜，通常情况下真菌性病害可以分为三类：
　　真菌病害的分类
　　1、低等真菌。
　　大多生长在水中或土壤中，主要病害有猝倒病、根腐病、霜霉病、白锈病、疫病、绵疫病等。一般在低温(15-20摄氏度)潮湿的春秋两季发病较多。
　　2、高等真菌。
　　主要病害有赤霉病、白粉病、炭疽病、叶斑病、黑斑病等。如：麦类赤霉病;花生黑斑病;葡萄、苹果、桃、瓜类、麦类、豆类、甜菜白粉病;棉花、豆类、瓜类炭疽病;苹果、梨黑星病;桃、杏缩叶病;瓜类蔓枯病;葡萄黑腐病、房枯病;苹果轮纹病、黑腐病、腐烂病、干腐病;葱叶枯病;茄子褐纹病等。病害以点发生为多，受害部位有较明显的边缘，而形成一定形状的病斑。
　　3、最高等真菌。
　　引起的病害主要有黑粉病、锈病、纹枯病和立枯病等。如：禾谷类作物的黑粉病、腥黑粉病、粒黑粉病、叶黑粉病，梨、桃、苹果、葡萄、豆类、花生、葱、向日葵锈病，棉花、茄子立枯病。一般只引起局部侵染，形成点发性症状。
　　真菌病害的用药
　　首先要对防治真菌病害的农药有个了解。防治真菌病害的药很多：如常用的百菌清、恶霜·锰锌、甲霜·锰锌、苯醚甲环唑、三唑酮、烯唑醇、多菌灵、甲基硫菌灵、代森锰锌、腈菌唑、戊唑醇、氟硅唑、乙膦铝、腐霉利、阿米西达等。
　　其中防治低等真菌病害的有：恶霜·锰锌、甲霜·锰锌和乙膦铝等;防治高等真菌病害的有：苯醚甲环唑、三唑酮、腈菌唑、戊唑醇、氟硅唑、烯唑醇、多菌灵、甲基硫菌灵、腐霉利等。
　　对高等真菌和低等真菌病害都有效果的有：百菌清、阿米西达和代锰锌，其中百菌清和代森锰是保护剂。阿米西达是一个对低等、高等真菌都有杀灭活性的最广谱内吸性杀菌剂。
　　知道了病害和药剂，就可以根据致病真菌来选择相应的杀菌剂，如霜霉病、晚疫病、绵疫病、猝倒病等是低等真菌病害，就可选用恶霜·锰锌或甲霜·锰锌;对叶斑病、叶枯病、炭疽病、白粉病、黑粉病、黑星病、早疫病、赤霉病等高等真菌病害，就可选用苯醚甲环唑、三唑酮、多菌灵、甲基硫菌灵、腈菌唑等。