首先用于贮藏种子的库房，应具备防水、防鼠、防虫和防菌、通风、防火等基本条件。种子库绝对不能在雨雪天气时地面积水或有其他任何来源的水与种子接触，否则种子会因水分过高而加快呼吸、发热和生长霉菌，甚至还会促使种子萌动，从而降低种子的品质。因此，要及时消除库房建筑屋顶和墙壁上的小洞与裂缝，设置具有防水层的底板（沥青或油毡），仓库内墙面在种子堆以下的最好也能刷沥青防潮。真菌等在潮湿、温暖的条件下生长最适宜，仓库内温度的差异会引起水汽从高温处向低温处移动。通常是从种子堆内部移向表面，从而给真菌生长提供适宜的条件，所以仓库应保持低温、干燥的条件，此时通风设备对防止水分增加就显得尤为重要。

2.严格控制入库种子水分

小麦种子贮藏期限的长短、取决于种子的水分、温度、及贮藏设备的防湿性能，为此，小麦种子贮藏时的水分都应控制在12％以下，种温不超过25℃。

3.定期检查种子堆的温度

每月查4次，风雨必查，主要查种堆上、中、下层，墙边、墙角，柱边和种温虫情，防止雨漏，出现雨漏及时处理。种温的变化能在一定程度上反映出贮藏种子的安全状况。检查时散装种子一般在种子堆l00 平方米面积范围内，分成上、中、下三层，每层设5个检查点，共15处。经过包装的种子采用波浪型设点方法，最好每天都能测一次，测定时间以9： 00~10：00为宜。种子水分也是重要的检查项目，根据种子水分的变化规律，散装种子以25平方厘米为一个小区，也是分三层5点，共15个检查点。检查时可先用感官法，即通过色泽、潮湿与否、有无霉味、是否松脆等，确定是否需要进行仪器检查，一般一年中一、四季度每季度检查1次，二、三季度每月检查1 次。

4.定期检查发芽率

种子在贮存期间，其发芽率因环境条件和贮存时间不同而发生变化，因此定期检查发芽率是十分必要的。根据发芽率的变化，及时采取措施，从而避免不必要的损失。通常情况下，发芽率应每4至6个月检查1次，在高温或低温过后、药剂熏蒸之后都应检查1次。

5.消毒

入库前空仓消毒，入库完毕应进行磷化铝药剂熏杀，防止因虫害和微生物大量繁殖活动而造成的种堆发热。