一、采收标准

荠菜3月中旬始开花，5月初便可采收种子。当花已谢，茎微黄，可从果荚搓下种子，种子颜色已发黄时，便是老熟征象。估计整个田块已达九成熟时，便可进行收割。

二、种子的凉晒

采收以晴天的早晨为好，中午不可采收，以防果荚裂开将种子散落地上。收下的种株先摊在地上，当露水晒干后，便可放入竹匾中，用洗衣板搓下第一次收得的种子（也是一级种子，质量较好）。种子搓下后，须筛去杂质并立即摊成薄层晒干，不可放在盛器内积压数小时后再行摊晒，否则易发热，损坏种子，影响种子的质量，一般连晒三个太阳，中午如阳光过烈，上面可盖一些草帘，晒时不可用手去翻盖一些草帘，晒是不可用手去翻动，否则会损坏种子。晒种子时如遇天雨，应及时收放屋内，不可将油布或塑料薄膜向上一罩而不收，否则，匾内种子上水分热气无发散，降温降湿，便会蒸坏种子。

三、种子的贮藏

待种子充分干燥后，便贮藏于干燥的甏内（忌用放过肥料和有盐分的甏，否则要损坏种子），贮藏前要将甏先晒一下，并打扫清洁，甏的底部可放入用纸或纱布包一些生石灰的纸包，用以吸湿，纸包上再填放几张纸，以防种子与生石灰包直接接触，纸上面再盛放种子，直至盛满甏口。种子上可放少许樟脑丸或用“六六六”粉纸封口，最后甏口加盖密封，置于高燥通风凉爽的贮藏室内。如不是地板房屋，则种子甏下面应在离地1尺许处垫以木板，防种子受潮影响质量。甏内甏外均须放入标签，注明所藏种子的年份、数量、等级等，以便登记入账和防止弄错。

如果采收种株时，正值雨天，一时难晴，非采收就要散落种子和发芽，这种情况下就应及时抢收，用刀子将种株割下来，放置阴凉通风处，摊开晾干水分，待天好时晒几个太阳，再如前法进行脱粒，筛扬去杂，摊成薄层，晒干收藏。好的种子为金黄色，发过酵的种子为紫黑色。其成熟的种子在自然气候下，须休眠至秋季始能萌发。

第一次采收搓下的种株，待数天后还可再进行第二次搓种（二级种子），其质量略差于第一次采收的种子。但这次种子的种皮较薄，播后出苗反而快，如与第一次搓下的种子混和播种，则出苗有先有后，可分批采收均衡供应。也有在采收种子时，为节省劳力，将种株与河泥层积贮藏的。目前以干子贮藏方法最干净省便，且种子不易受到损坏。

四、甏的选用

贮藏种子的甏，最好能根据种子的多少而选用容积相适应的甏，以刚能装满种子为最好的，因这样可密封，甏内空气少，有利种子久藏不坏，可延长其使用年限。一般贮藏好的种子可用2～3年。荠菜种子千粒重在0.12克左右。