农药使用不当会对植物生长发育产生不良的影响，或使农作物品质下降，产量降低，甚至无收成。这就是农药对植物的药害。药害可以分为急性和慢性两种。急性药害在施药后几小时或几天很快出现药害现象。如焦灼、穿孔枯黄、变色或畸形，果实上出现各种锈点、褐斑、色点等药斑；根发育不良或形成黑根、鸡爪根；种子不发芽或幼苗畸形，严重的造成落叶、落花、落果等，甚至全株枯死。慢性药害在施药后并不很快出现药害现象，但植株生长发育受到抑制，经过较长时间才表现出生长缓慢、矮化发育不良，开花结果延迟，落花落果增多，低产，品质差。此外，前茬使用的农药，遗留在土壤中，可以对下茬作物产生药害。引起药害的原因很多，主要是以下三个因素：
一、药剂因素药剂的理化性质与植物的药害关系最大。一般情况水溶性强的分子小的无机农药易产生药害。一些油剂能堵塞作物的气孔而造成药害；农药的品质差，使用后易产生药害；农药混用不当，产生药害；药剂浓度过高，超过了植物承受的能力而产生药害；重复喷洒或连续喷洒、施药和拌药不均匀易产生药害。
二、植物因素 不同农作物、同一作物的不同品种，或同一品种的不同生育期对农药的敏感性有很大差异。在作物的发芽期、幼苗期、花期、孕穗期以及嫩叶、幼果上施药，易产生药害。
三、环境因素 高温加强药剂的活性和植物的代谢作用，易产生药害。含有机质少的、或砂性强的土壤中施药，易产生药害；药剂浸种或拌种后的种子，播在干旱的土壤中易产生药害，降低发芽率等。