疫苗的合理使用是关系到免疫成败的关键。疫苗接种前，要认真阅读瓶签及使用说明书，不得任意变更；养猪户应按照以下方法合理使用疫苗。
1.注射病毒性活疫苗的前后各4天内不准使用抗病毒药物和干扰素等，两种病毒性活疫苗一般不要同时接种，应间隔7～10天，以免产生相互干扰。
2.病毒性活疫苗和灭活疫苗可同时使用，分别肌注，注射活菌疫苗前后7天不要使用抗生素，两种细菌性活疫苗可同时使用，分别肌注。
3.抗生素对细菌性灭活疫苗一般没有影响，可以同时使用，分别肌注。
4.正在潜伏期的猪接种弱毒活疫苗后，可能会激发疫情，甚至引起猪只发病死亡。
5.妊娠母猪尽可能不要接种弱毒活疫苗，特别是病毒性活疫苗，避免经胎盘传播，造成仔猪带毒。
6.发高烧、老弱、病残猪只不要接种疫苗。
7.疫苗稀释后效价会不断下降，气温15℃以下4小时失效、15～25℃2小时失效、25℃以上1小时内失效。因此，稀释后的疫苗要在规定的时间内用完，不能过夜，否则废弃。
8. 抗体水平的高低与疫苗注射剂量有正相关性，但是免疫接种时一定要按规定的免疫剂量注射，不要人为的随意增大剂量，超大剂量的接种会导致免疫麻痹，使免疫细胞不产生免疫应答；当抗体水平高时接种疫苗会发生中和反应，反而导致猪体免疫力下降。尽可能使用单独的疫苗，少用联合疫苗与多联苗。
