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当种子成熟时要及时采集，选择品种典型、性状优良、枝叶茂盛、无病虫害、正处壮年的母株采集种子。不同种类花卉种子的采收要掌握其成熟特征适时采收。如一串红种子呈深褐色，石竹种子呈黑色，天目琼花果皮呈红色，牡丹种子呈黑色时即可采收。而有些种类如凤仙花、蝴蝶花、飞燕草、矮牵牛、锦带花、丁香等，果实易开裂，需在开裂前及时采收，以避免种子散落。还有些种子是陆续成熟的，如枸杞、醉鱼草、一串红等，需随时观察，及时采收。 种子采收后，要分类编号，防止品种混杂，有的种类要及时洗去果皮，取出种子，晾干。有的要脱粒，清除杂质，经晾干，再精选，留下籽粒饱满的种子，扬弃瘪壳、破碎和霉变的种子。最后将种子放入特制的种子袋或信封中进行贮藏保存。一般花卉种子适宜于干藏的方法，在干燥、密封和低温的环境条件下，可以较长时间保持其生活力。通常将种子袋置于3～5℃的冰箱内贮存，种子生存寿命即可成倍增加。牡丹、芍药、白玉兰、玉兰、含笑等种子收获后，应采用沙藏层积处理法，即一层沙一层种子间隔排列，保持沙土湿润，使种子度过后熟期，沙藏到翌春播种。睡莲、玉莲的种子收后则必须贮藏于水中保存。
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