杂交稻种子由于亲本生理差异，其内外颖闭合较差，病菌易侵染危害，尤其穗萌稻种由于穗上已萌动发芽，养分大量消耗，千粒重和生活力降低，其浸种催芽时对高温、高湿、缺氧条件的适应性减弱，若采取传统的高温催芽、三浸三滤浸种催芽方式，易导致胚乳外溢，嫌气条件下病菌危害加剧，活力丧失，造成烂种烧芽。
     　　为避免穗发芽种、隔年种浸种催芽时烂种烧芽现象发生，更好地协调催芽时温、气、水矛盾，近年来，我们从实践中摸索总结出一浸二滤浸种催芽方法。具体操作方法是：①先将晒好的种子用清洁水或活水淘洗，去掉浮在面上的秕粒、芽粒、病粒；②滤后的好种子用活水浸泡一昼夜；③浸泡后的种子用清洁水淘洗干净；④ 将稻草均匀平铺地面后，用清洗后无杂物的麻袋铺于草面上；⑤将种子均匀铺在麻袋上，厚度8～10cm，种子上再覆盖一条湿麻袋(若种量少，可将湿麻袋对折覆盖于种子上)；⑥麻袋上及周围用稻草包裹保温；⑦若麻袋干燥时，及时用活水淋湿。此方法在日均温15℃以上条件下只需3～4d即可达到发芽标准，既安全又简便。