烟草种子的处理与加工主要是通过四种方法改进和提高种子质量。其一是把异作物和杂草以及无生命杂质分离出去；其二是清除劣质种子，提高种子质量等级；其三是应用植物生长剂、中微量元素、农药对种子进行处理，预防种传病害及提高种子活力；其四是包衣丸化，提高烟草种子综合抗逆能力。总之，处理与加工的最终目的是获取高净度、高活力、高耐贮性及无病虫侵害的烟草种子。烟草种子的处理主要包括：收种、脱粒、干燥、精选、分级等。
 
　　一、种子的收获与脱离
 
　　田间良繁生产的种子，在花枝蒴果半数（50％）以上呈褐色，其余蒴果也开始转褐色时便可进行蒴果（种子）的收获。收获后的蒴果在晾晒场地进行晾晒，直到蒴果全部干燥，便可进行种子脱离。在这期间要防止种子因水分、通风不畅发生霉变，从而影响种子的质量。
 
　　二、烟草种子干燥
 
　　种子干燥处理是保证安全贮藏的前提，也是保证播种质量必不可少的环节。经过充分干燥后的种子，可使其新陈代谢作用进行缓慢，从而延长种子寿命，保持较高的发芽率。同时还有杀虫和抑制微生物的作用。
 
　　1、种子干燥的基本原理
 
　　种子是活的吸湿材料，结构复杂，水是其普遍存在的基本组成部分。由于种子是吸湿物质，其含水量取决于空气中相对湿度和温度，两者关系中的决定因素是存在于种子及周围环境中的水蒸气压力。当种子内蒸汽的压力大于周围环境中的压力时，水分就从种子内散发出来；当周围环境中的蒸汽压力大于种子内的压力时，水分就进入种子内；当水蒸气压力相等时，种子内的含水量与周围大气中的含水量基本处于平衡状态。根据这个原理，要干燥种子，必须使种子内的水分散发到周围的空气中。种子体内水分的散发率取决于种子的水分从体内转移到表面再转移到周围空气中的速率。而种子的温度、大气的温度、种子的物理结构和化学成份以及种皮的渗透性又直接影响着种子的水分从中心向表面转移的速度。同时，种子的表面的饱和程度及空气的相对湿度和温度又影响着表面水分散发的速度。
 
　　因此，降低种子水分，必须有一定温度的流动空气通过种子，才能收到良好较果。
 
　　2、影响种子干燥的因素
　　
　　（1）大气压力 
 
　　气压高水分蒸发得慢，气压低水分蒸发得快，种子内部水分的蒸发也如此。
 
　　（2）相对湿度 
 
　　在温度不变的条件下，干燥环境中相对湿度决定了种子干燥速度和种子的失水量。如空气的相对湿度小，对含水量一定的种子，其干燥的推动力大，干燥速度和失水量大，反之则小。但在烟草种子贮藏环境中相对湿度应在35%以下为宜。
 
　　（3）温度 
 
　　温度是影响种子干燥的主要因素之一。温度高，一方面具有降低空气相对湿度，另一方面能促进种子内部水分的扩散和表面水分蒸发。但在贮藏条件下烟草种温不宜超过20摄氏度，15度以下最宜。
 
　　（4）气流速度 
 
　　种子干燥过程中，吸附在种子表面浮游状的气膜层，能阻止种子表面水分继续蒸发。空气的流动快，则种子干燥速度快。
在种子干燥过程中，温度、湿度和气流速度之间存在着一定关系，温度越高，相对湿度越低，气流速度越快，则干燥效果越好。但对烟草种子而言，在干燥过程中必须确保不影响种子活力，否则失去了种子干燥的意义。$page$
 
　　3、烟草种子干燥的方法
 
　　烟草种子目前有自然风干、晒种、机械干燥三种。
 
　　（1）自然风干
 
　　烟草种子的自然风干主要指蒴果枝在收获后，挂在专业晾房内自然风干，自然风干的另一作用是种子的后熟，利于进一步提高种子质量。自然风干的时间一般为15-25天。
 
　　（2）晒种
 
　　晒种是烟草种子干燥最简易的方法，晒种要选择晴天，要求气温高、光线足，一般晒2-3天，晒种不仅可降低种子水分，还可杀死部分病菌，激活种子内酶活性。
 
　　（3）机械干燥
 
　　种子干燥的设备很多，但目前实践的经验是利用烤烟机械烘烤设备，云南多年来采用北京普照公司的“烤霸”系列烤机。一是采烟季节用于调制烟叶；二是种子收获时用于干燥入库；三是包衣种子生产期间用于包衣种干燥。烟草裸种、包衣种干燥温度控制在40-42C之间，温度差4-6C。不必开启通风口。时间在5- 6小时，裸种含水量在7%以下，包衣种含水量在5%以下。
 
　　三、烟草种子精选
　
　　种子精选是利用种子物理特性的差异，用物理或机械方法将异作物和杂草以及无生命杂质清除，利用光、热、电等方法抑制病原菌，保持种子健康，提高种子的活力和种子的质量。种子的物理特性主要是指种子的大小（宽、厚、和长度）、重量（千粒重）、表面特性、颜色及带电性质等。
 
　　1、筛选
 
　　烟草种子收获后，首先就过筛选，采用30目铜筛隔大粒（片）杂质，采用50-60目铜筛过小粒（片）杂质和细尘。
 
　　2、风选
 
　　由于烟草种子细小，筛选后仍有一些杂质大小同种子相差不大，难于清除，由于一般带病种子不能充分成熟甚至不能成熟形成秕粒，因此比健康（不带病）种子轻，这时要用风选方法清除杂质和秕粒。一般用小风箱和大风箱，方法以手感出种口种子净度为准。
 
　　3、水选
 
　　水选是利用不同的比重，将杂质、病原物同种子分开。烟草种子水选一般是在包衣前或播种前，用大盆或在池内浸泡6-8小时，其中每小时搅动1-2次，取下层种子。水选一般可结合药品浸种进行。
 
　　4、机选
 
　　机选是应用专业机械进行选种的方式，根据各地的实际情况，选用符合自身条件的种子精选器械进行种子的精选。