农田施用除草剂的方法主要有茎叶处理法、土壤处理法和杀草薄膜除草法等。

茎叶处理法该法是将除草剂直接喷洒在正在生长着的杂草叶面上。茎叶处理又可分为播前茎叶处理和生长期茎叶处理两类。播前茎叶处理是在农作物未播种或移栽之前将除草剂喷洒在已生长的杂草上，能够有效地杀死杂草，对这类除草剂的要求是广谱性、药效期短、落在土壤后药剂很快分解，常用的有草甘膦、克无踪等。生长期茎叶处理是在农作物出苗后喷洒除草剂处理消灭杂草茎叶的方法。这种处理方法在将除草剂喷洒到杂草上的同时也可能会喷洒到作物上，因此，一般要求除草剂应具有选择性。如使用2，4-D丁酯、二甲四氯、百草敌等，能防除麦田双子叶杂草，却对小麦安全；使用敌稗能有效地杀除稗草，而对水稻无影响。对有些选择性不太强的除草剂可采取定向喷雾的方法，达到既保作物安全又防除杂草的目的。茎叶处理法使用的除草剂一般都是乳油、水剂、可湿性粉剂等类型，对水喷雾。油剂类型的除草剂可用超低容量喷雾器直接喷雾。

土壤处理法可分为播前、播后苗前、苗后土壤处理三类。播前土壤处理是在作物移栽或播种之前将除草剂施在土壤上，并均匀地混入浅土层中，形成一定深度的药土层，杂草萌芽或穿过药土层时，接触吸收药剂导致中毒死亡。这种处理方法的优势是能够减少除草药剂的挥发与光解。在地表墒情差的情况下，混土处理药效高，除草效果好。播后苗前土壤处理是在农作物播种后出苗前对土壤处理，目前大多数除草药剂都是采用这种方法施用的，这些药剂主要是利用“位差选择”进行除草的。苗后土壤处理是在作物生长发育期处理土壤，比如稻田在植苗后使用的杀草丹等，这种除草剂常采用颗粒剂施药。

杀草薄膜除草法 此法是利用含除草剂的薄膜杀除杂草的。其方法是，先在薄膜上按农作物的栽培要点打好孔，然后覆盖于农田表面，在孔中播种或栽移，作物通过膜孔向外生长，因其薄膜含除草剂，杂草萌芽顶到薄膜后被杀死。这种药用薄膜可用于棉花、花生、蔬菜等农作物田除草。