一、不要选病虫害严重的棉株。枯、黄萎病的棉株和抗虫性不好的棉株一定要淘汰，在重病地表现良好的棉株则可以留种。
　　二、不要选伏前桃和晚秋桃。伏前桃和晚秋桃生长发育不良，成熟度差，铃重轻，种子发芽率低，长势弱，不宜选用。
　　三、不要用“剥桃花”的棉籽。有些棉农对发育较为充分的伏桃，仍然有“剥裂嘴桃、摘湿花”的陋习，由于其没有充分成熟，更没有完成后熟，绝对不能留种。
　　四、不要用喷乙烯利的棉籽。喷施乙烯利虽可促棉花早熟5～7天，但对棉籽损伤较大，致使其发育不全，不能作种。
　　五、不要用退化严重的品种。棉花是常异花授粉作物，异交率在3%～20%，抗虫棉品种在经过几年的连续繁殖过程中，如果不加以提纯复壮，常因昆虫传粉而造成生物学混杂。对纯度不高的地块应避免留种。
　　六、不要选杂交棉品种。在当前的科技水平下，杂交棉品种并不完善，且F2代的分离现象十分严重，应避免采用。
　　七、不要在水泥地面上晒。在水泥地面上晒含水量较高的棉籽，会使部分棉籽形成“哑籽”，失去发芽能力。
　　八、不要与农药、化肥一起存放。有些农户将棉籽与农药、化肥长期存放在一起，由于通气不良且农药、化肥散发的有毒气体损伤棉籽正常的生理，造成发芽率锐减。