给大豆科学施肥要采用有机肥料和无机肥料相结合，重施底肥，配合施用种肥，适时合理追肥。
一、增施经过腐熟的优质有机肥。每公顷大豆田宜施用有机质含量8%以上的有机肥20000千克以上，或纯农家肥1000千克以上，结合整地做底肥1次施入。
二、采用测土配方施肥技术，氮、磷、钾合理搭配。一般每公顷施肥量按纯氮18~36千克、五氧化二磷46~92千克、氧化钾30~60千克，施用时折合成所用化肥的实际用量。同时增施中、微量元素肥料，每公顷施用硫酸锌15~30千克。
三、施肥方法宜科学。科学施肥即分层施肥，也就是基肥深施，种肥浅施。分层施肥适宜的分配比例为底肥占氮、磷、钾化肥总施用量的3/4，种肥占氮、磷、钾化肥总施用量的1/4。
1、底肥。氮、磷、钾化肥总施用量的3/4量做底肥，施于种下8~12厘米。一般与有机肥一起结合秋翻整地一次施入。
2、种肥。氮、磷、钾化肥总施用量的1/4量和部分中微量元素肥料做种肥，施于种下3~5厘米。切忌大豆种与氮、磷、钾化肥同施，以免烧种。但钼是大豆固氮酶的重要组成部分，大豆施用钼肥效果好。通常钼肥宜作拌种用，1千克种子拌钼酸铵2克，方法是用温水（水和种子的比例为1 ：2）在盆里把钼酸铵化开、搅匀，然后把豆种倒入，拌匀即可，亦可结合拌农药时拌入。
3、追肥。①根部追肥。是指大豆开花结荚期，在土壤肥力较差的地块，当底肥和种肥满足不了大豆生长发育要求，大豆植株长势较弱时，每公顷可追施尿素50~75千克，过磷酸钙75~150千克。必要时每公顷可配施硫酸钾75千克左右。追肥方法：多采用铲完最后一遍地时，将肥料均匀地施于豆株一侧，追肥时注意不要碰到叶片上，也不要紧靠近根部，然后进行趟地覆土。②根外追肥（也叫叶面喷肥）。在土壤供给养分充足时，也可使用。在大豆开花始期或鼓粒初期，每公顷用5~7.5 千克尿素和1~1.5千克磷酸二氢钾对水500千克，叶面喷施，增产效果显著。大豆对缺锌敏感，通常应在花期喷施，一般用0.2%硫酸锌水溶液，方法是按每667平方米用硫酸锌100克对水50千克，搅匀，然后选择在无风的下午喷施，隔1周再喷1次。注意浓度不宜过高，以防发生肥害。