以农业防治措施为基础，以种植抗、耐病良种为主体，采用高效、安全药剂进行穗期保护。
　　1.农业防治措施
　　改善小麦生长环境
　　深耕灭茬， 适时播种， 合理施肥， 适时、合理排灌，在常年赤霉病流行麦区特别重要的是建立一套以排为主的排灌水利系统，以降低地下水位，避免渍害、湿害和降低田间湿度，创造和提供有利于小麦而不利赤霉病发生的生态环境。开沟排水系统良好的麦田，防病效果在病情不重年份有50％左右，重病年为30％左右。
　　麦田开沟，关键不决定于深度，而取决于畦沟、腰沟、渠道与河湖畅通。
　　抢时机及时收割、脱粒、干种入仓有的年份，收割期多雨，成熟的丰产小麦难以收割、脱粒，堆放在田间，或脱粒后未晒干时，放入室内，这样，由于麦粒学水分多，赤霉菌仍能蔓延为害，使病粒骤增而无法利用，损失严重。
　　2.穗期药剂保护
　　在小麦扬花期间喷药保护是防治穗腐（枯）关键的措施。
　　一般情况在始花期（扬花10～20％）施药最好。