储存保管好药材种子，是确保来年丰收的一项关键性措施。多年的经验表明，中药材种子除了常规储存方法外，药农和其他种子管理人员还应掌握以下几方面的储存技巧，以确保药种发芽率，为下季药材生产做好准备工作。
　　一是把好水分关。药材种子含水量多少，是决定种子能否储存及储存年限的重要因素。药种含水量过多，易发热，会导致捂种、霉变、消耗养分过多等，直接影响种子的发芽率和活力。霉变严重时，药种便失去利用价值。刚收获的种子，虽然在脱粒过程中经过晾晒，但受时间、天气等因素影响，含水量不一定能达到安全含水量以下。故贮藏前要选择晴天反复充分晾晒，使含水量控制在安全线以下，含油类多的药种水分应控制在8％～9％，一股的药种水分应控制在12％～13％。如果数量多，可分期分批进行晾晒，每隔一段时间翻动一次，待种子含水量降到安全线以下后再装缸入库贮藏。
　　目前，有些药种销售部门改用各种包装袋出售药种。虽然包装袋都有防潮功能，但为了安全起见，装袋之前，也要充分晾晒，确保种子在密闭条件下不变质。
　　二是把好纯度关。药材良种要单收、单打、单晒、单独储存。晾晒时要单场晾晒，不要与其他品种的种子同场晾晒，以防混杂。在晾晒过程中，要彻底清除其中的茎、叶、杂草、泥沙以及秕子、虫破籽、霉变籽等杂物，使净度达到99％以上，储存库房间应进行常规消毒，严防药种受到污染。储存时应贴上标签，标明种子名称、重量、纯度、入库时间等，防止与其他作物（树、菜、粮、草）的种子混淆；要一个容器盛放一个品种，不能不加以包装就将几个品种同存于一个容器中，更不能将相像或相似、易混淆、难以分辨的药种同存一处。
　　三是把好存放关。药种储存量大时，要选择清洁、干燥、隔热、通风、防潮等条件好的专库储存。药种入库前，要将库内其他种子、垃圾等杂物全部清理干净，然后用10％石灰水消毒，用农药杀灭库内害虫和老鼠。药种存放要远离火炉，不能存放在厨房里，以免烟气熏蒸。种子如果长期被烟气熏蒸，易导致种子水分减少，影响种子发芽率。也不能存放在粉坊、油坊等场所，但可在存放其他粮食种子、棉花种子、农具等物的库房内专位存放。药种要放入麻袋、编织袋、布袋内，不可用塑料袋包装储存，因塑料袋会阻止袋内空气与袋外空气变换，产生有毒气体，妨碍种子呼吸，从而导致发芽率降低，同时，还会使含水量大的种子内多余的水分散发不出去，引起种子霉变。因农户的药种储存量较少，一般没有条件设专库，但也不要将种子与碳酸铵、尿素等氨态氮肥、农药混存一室。因为这些肥料、农药的挥发性极强，挥发的物质极易被种子所吸收，会腐蚀种子细胞和种胚，严重影响发芽率和种子活力。
　　四是把好温度关。温度是影响种子新陈代谢的主要因素。储存的药种不宜暴晒过度，同时切忌在水泥地面和铁板上晒种，因温度太高，易将种子烧坏。高温晾晒过的种子，要在傍晚降温后再入库。储存药种的仓库温度最好保持在20℃以下，这是因为随着温度上升，种子的呼吸量也不断增大，当种子温度超过 40℃时，种子呼吸旺盛，将消耗自身储存的营养，从而降低发芽率，损坏药种。散装种子应在种子中间插放通风草把，有利于通风降温，种子在库内存放不能过满，要留出30％的空间，以利通风换气。室外存放的种子，受冻后不要再转到暖室内，暖室内的种子也不要移到室外，以避免骤冷骤热，温度变化过快影响种子活力。
　　五是把好湿度关。药种贮藏期间，常会遇到多雨、高温、高湿天气。高温高湿会加强种子的呼吸作用，微生物极易在种子堆内繁殖，引起药种发热霉变，以致丧失种用功能。因此，药种应存放在干燥通风处，切忌放在封闭、潮湿的仓库中，尤其是存放之前，要在地面上用砖头或者圆木等垫高50cm以上，再将盛药种的容器依次放上，不能把种袋直接堆放在地面上，并要远离墙壁30cm，避免潮湿使种子降低发芽率。也不能把种子存放在蒸气大的屋子里。室外存放的种子，不要让雨淋湿，以免发生霉烂。此外，在贮藏过程中应经常晾晒，适时通风换气。
　　六是把好防鼠防虫关。药农储存的种子如数量不大，可选用水泥缸、瓷缸贮藏，可起到防鼠防虫的作用。整个储存期间，一定要定期检查，尤其3月份以后，气温回升，发现害虫应立即采取有效防治措施。防治老鼠、害虫惟一的方法就是采用药剂防治，其特效药是民用磷化铝，每200kg药种用药一片，用布包好，放入种袋内，密封7天即可杀死害虫。另外，也可用菊酯类喷雾杀虫剂杀死害虫。

　七是把好管理关。一些药种储存期间，正值多雨高湿季节，极易引起药种吸潮并发生霉变。储存期间要定时检查，检查的重点是温度和湿度。入库初期，每周检查一次，中期每10天检查一次，后期每20天检查一次。发现种子吸潮或温度过高时，要及时通风降温散湿，如通风仍不能解决问题时，就必须出库晾晒至达到安全含水量标准时再入库，整个储存期间，更要注意防火。
　　此外，如果无室内储存的条件，种子也可于室外露天存放，地面除垫高外，要用草帘或编席等盖严，上面再围好塑料布，用绳子等绑结实，压住四角，防止雨雪淋湿或大风吹坏。同样要做好防鼠害及在包装袋外贴上标记及防混杂等工作。