近年来，中国BB肥产业发展迅速，年设计产能10万吨以上的企业已由1987年的1家增加到目前的20多家。BB肥正在成为国内复混肥重要品种，其基础颗粒肥供应充足，生产设备与掺混技术日益国产化，大型企业不断涌现，系列化产品日益增多。
然而，在其高速发展的同时也浮现出诸多问题。从整体看，BB肥固有的优势及特征在国内尚未充分显现。据调查分析，中国BB肥产业在研发、生产、运输、销售、施用等各个环节都还不同程度地存在问题，尤其是BB肥的推广应用尚未与测土配方施肥技术有效结合起来，主要表现在：
配方技术含量低，产品针对性不强 目前市场上大多数BB肥配方均属高氮、高钾、高浓度型，缺乏中、微量元素。但从国内农业生产实际需求看，这一趋势很不合理。其一，高氮型配方并非适合任何土壤和作物施用，例如在有灌溉条件的大田作物上若一次过多施用氮肥，既可能造成产量和品质下降，又可能使氮利用率下降。小麦和水稻底肥氮施用过多，会造成前期无效分蘖太多，后期倒伏风险大，千粒重下降。其二，高钾配方对于粮食作物生产体系来说，并非都需要。如我国华北平原小麦主产区只有少部分农田缺钾，但市场上的BB肥几乎都含钾，这会带来钾资源的浪费。其三，部分地区一些作物已表现出对某些中、微量元素的针对性需求，而目前市场上含中、微量元素的产品较少。
企业农化服务不到位 据对山东化肥市场调查，约50％的BB肥生产企业没有给农民提供服务，给农民赠送科技资料的企业也只占30％，只有约10％的厂家有科技讲座和免费咨询电话，近半数BB肥企业对与农化服务关系紧密的测土配方、示范试验和农技培训等工作开展得极少。
生产规模过大，服务半径过远美国平均每套BB肥装置年产4000吨左右，每套装置服务的配方单元小于100个农场，服务半径在50千米以内，产品随用随配。而据不完全统计，国内BB肥厂单套装置年产能力一般在万吨以上，年产5万吨以上的至少有50套，10万吨以上的至少有25套，有的甚至高达30万吨。目前国内年产10万吨装置服务范围覆盖本省及其周边省份，这很容易因长距离运输和闲置时间加长造成养分分离而影响肥效，还可能降低BB肥的针对性。
供销体系尚未健全BB肥经过多个零售商或批发商才能到达农民手里，中间环节过多，这与BB肥减少中间环节避免或减轻颗粒二次分离的规律不符。整个BB肥供销体系中流动的只是产品，没有配套服务。生产企业、农业科研单位、经销商等联系不够紧密，没有合理利用各自资源，也未能充分发挥测土配方施肥技术应有的优势。
业界人士认为，BB肥推广应用与测土配方施肥相脱节，已对国内BB肥产业发展形成制约。企业和相关部门只有认清BB肥产业自身的运行规律及其特征，顺应市场需求，充分发挥优势，与测土配方施肥有效结合，才能真正促进BB肥行业健康发展。
以区域为单元研发主要作物系列产品 针对国内农业分散经营、种植结构复杂多样、单产水平较高、产业化程度低的状况，国内BB肥的研发应按养分资源综合管理技术原理设计产品，综合考虑作物自身需求与土壤、气候等环境条件的影响，并针对各地需求，研发适用于本区域主要作物类型的BB肥产品及建立与之配套的施肥技术体系。
划分适中的BB肥配方单元 国内划分BB肥配方单元以选取自然条件均一、作物种类丰富、服务半径适中的数个地级市为一个配方单元为宜，这样才能保证发挥BB肥针对性强的优势和满足配方单元内农业生产对BB肥产品多样化、品牌化的需求，同时避免或减轻BB肥因贮存时间过长和长途运输可能产生的颗粒分离问题。以山东滨州为例，小麦、玉米、棉花、蔬菜、水果五种主要作物种植面积约56.6万公顷，需肥量为33.8万吨左右。按此计算，在滨州建设一家年产10万吨BB肥厂，基本可满足当地用肥需求。
构建BB肥供销体系 国家应鼓励那些有一定农化服务基础，有实力开展测土配方施肥工作的大型肥料企业，建设众多规模适中、星罗棋布分布于主要农业区的BB肥厂，并鼓励与农业大学、研究所和农技推广部门加强合作，利用各自资源优势，共同为农户提供科学施肥等多项服务；给予BB肥产业在税收、运输、信贷等方面的相关优惠政策；建立BB肥产品企业标准，尤其要考虑通过严格的标准将其养分分离控制在不影响肥效的范围内；加强BB肥质量管理与监督工作。
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