加州鲈鱼产业规模做大之后，随之而来的病害问题也越来越受到重视。加州鲈鱼主要是两类病害，一是虫害，二是细菌性疾病。在鱼苗期，容易发生车轮虫、杯体虫，大鱼期间斜管虫（季节性出现）、车轮虫、孢子虫虫害。细菌性疾病则主要是出血病、肠炎病、烂身病和烂鳃病。其中烂身病在每年的12月份至翌年的4月份较为常见，危害对象以成鱼为主，损伤后的鱼很容易引发此病，全塘鱼发病率高达80%，但死亡率不高，主要是影响鱼的商品价值。而烂鳃病终年都有发生，20℃以上时开始流行，流行的最适水温为28℃～35℃，不论鱼种或成鱼阶段均可发生。除了虫害和细菌性疾病外，近年新出现另两种新的疾病，即烂尾病和疑似诺卡氏菌病。据广东省顺德区有关专家鉴定，初步确定烂尾病主要是病毒感染引起，同时并发病原细菌综合感染所致，发病死亡率高达40%以上。而疑似诺卡氏菌病流行季节较长，从5月至11月均有发生，发病高峰在6月～9月，水温23℃～32℃，发病呈慢性型。根据养殖户反映，最近两年烂身病和孢子虫害常常并发，比较难治疗。
　　因此，建议在养殖过程中做好鱼病综合防治工作：1．鱼种放养前可进行药浴。2．定期泼洒药物。
　　平时发现池水过肥、水质恶化时，适当泼洒生石灰。3．定期口服药饵。
　　从6月份开始，每月一次，将药物拌入加州鲈鱼饲料，3天～5天为一个疗程。土霉素每天5～10克/50公斤鱼。另外，经常添加水产专用维生素，可提高抗病力。
　　首先是把好种苗关。在购买加州鲈种苗时不买打激素繁育出来的种苗，一定要选自然繁殖的种苗；而且在购买种苗时要先了解种苗场的亲本来源，选择不同地方亲鱼交配繁殖出来的种苗，一定不要近亲繁殖的种苗，种苗质量好，减少了感染疾病的机会。其次是把好饲料关。一般在高温季节会在冰鲜鱼中定期添加多维素，这样可以增强鱼的抵抗力，减少疾病发生。第三是把好水质关。重视水质调节，每年养殖前一定要清塘、毒塘。并定期杀虫，而且选用无公害的杀虫药物，如碘制剂等。低温季节每月杀一次虫，高温季节每月杀两次虫。杀虫时能把过多的水蛛杀掉，池塘里藻类便长得很，有利于光合作用，保持水质稳定。养殖户在养殖过程中可以借鉴这些经验，从环境、饲料、种苗等各方面去做好病害防治工作。