穴盘育苗的特点是每一株幼苗都拥有独立的空间，水分养分互不竞争，幼苗的根系完整，移植后的成活率接近100%，移植后的生长发育快速整齐商品率高。因此，穴盘育苗在花卉育苗上的应用是一种新的发展趋势。 
　　花卉种子小、价格高是花卉生产中一个突出问题。因为种子小，往往造成幼苗阶段生长缓慢且娇嫩，苗期时间过长，成苗率低；种子价格高，导致成本高，影响生产的收益，给花卉企业带来损失和风险。采用穴盘育苗方式，可以大大提高花卉育苗的发芽率和整齐度，缩短培育时间，提高花卉的商品价格和商品率。尤其对使用小粒种子育苗的盆花和花坛苗来说，无疑是一次很重要的技术进步。
　　四个阶段
　　美国的戴维·柯瑞恩（Davidkoranski）将穴盘育苗的生育期分为四个阶段。之所以将育苗划分为四个阶段是因为这四个阶段的生长状态与所需要的温度、湿度（相对湿度）、光照、肥料等环境和管理条件各有区别。这四个阶段的管理好不好，不仅对幼苗期的发育而且对花卉的形状、开花数量、生产周期都有很大影响。如瓜叶菊，如果温度在第二阶段超过28℃，则很容易造成胚轴过于伸长，极容易倒伏。而四季海棠如果第二、三阶段不能及时施肥的话，以后施肥也会造成生长迟缓一个多月。
　　第一阶段从播种到种子初生根（胚根）突出种皮为止，即所谓的“发芽”期。发芽期最主要的特征是需要较高的温度和湿度。较高的温度是相对于以后三个阶段来说的。种子发芽所需要的温度一般在21℃～28℃之间，大部分在24℃～25℃为最适温度，持续恒定的温度对种子来说可以促进种子对水分的吸收，解除休眠，激活生命活力。较高的湿度可以满足种子对水分的需要，首先，软化种皮，增加透性，为种胚的发育提供必需的氧气；其次作为种子生化反应的溶剂，促进其生物化学反应的完成，由一种新的生命形式替代潜在的生命状态。
　　第二阶段种子发芽以后，紧接着是下胚轴伸长，顶芽突破基质，上胚轴伸长，子叶展开，根系、茎干及子叶开始进入发育状态。这一阶段称为第二阶段。第二阶段的管理重点是下胚轴的矮化及促壮。如果下胚轴伸长过快，就会引起幼苗徒长。要想促壮及矮化幼苗的下胚轴，必须严格控制栽培环境的各个主导因子，如温度、湿度、光照等。幼苗子叶展开的下胚轴长度以0.5cm较为理想，1.0cm以上则有徒长的现象。下胚轴若太长，当真叶开始伸展时，随着真叶的叶面积增大及叶片数目的增多，其机械支撑力量不足，容易发生倒伏现象。当下胚轴太长而形成倒伏之后是无法恢复的，所以下胚轴的矮化及促壮是提高成苗率的关键。第三阶段主要是真叶的生长和发育。这一阶段的管理重点是水分和肥料。水分的管理重点在于维持生育期间的水分平衡，避免基质忽干忽湿，做到在适当的时候给予适量的水分。在人工浇水的条件下，要先观测基质的干湿程度和蒸发情况，确定浇水的时间和浇水量。在自动喷灌条件下，一天浇水三次，每次给水量约达到基质持水量的60%为宜。浇水时间分别为8点、11点及14～15点之间。16点之后若幼苗无萎蔫现象，则不必浇水。降低夜间湿度，减缓茎节的伸长，矮化幼苗是管理追求的目标。
　　进入第三阶段的幼苗要开始施肥。最始肥料的浓度为2500～3000倍（或100～150ppm）足够，当最初的两片真叶完全展开之后，肥料浓度增加到2000倍。肥料氮、磷、钾的比例选择氮含量较低的配方（N∶P∶K=15∶10∶30），以减少叶面积的快速生长，降低其蒸腾作用。营养过量，除了容易造成徒长弱苗之外，基质的电导率增加，根系的正常发育也会受到影响。
　　第四阶段幼苗生长到3～4片真叶时，也就到了第四阶段。此阶段的幼苗准备进行移植或出售。移植前要适当控水施肥，以不发生萎蔫和不影响其正常发育即可。
　　育苗期间各阶段的主要管理指标见附表。
　　物质条件
　　穴盘和基质是穴盘育苗必备的物质条件。基质的种类很多，为适应不同的卉育苗的需要，基质的配比也有所区别。一般原则是种子越小，需要的基质越细。基质的主要组成有草炭土（CSP）、椰糠、珍珠岩、蛭石等。基质的基本要求是无菌、无虫卵、无杂物及杂草种子，有良好的保水性和透气性，pH值 5.5～6.5，EC值低于0.75mmhos/cm3。生产中常将草炭和珍珠岩（或蛭石）以(3～3.5)∶1的比例混合。育苗基质原则上是新基质，不使用旧的材料，即使如此，在播种前最好也用600～1000倍液的多菌灵或百菌清消一次毒。
　　穴盘的穴格及形状与幼苗根系的生育息息相关，穴格体积大，基质容量大，其水分、养分蓄积量大，对供给幼苗水分的调节能力也大；另外，相对地还可以提高通透性，对根系的发育也较为有利。但穴格越大，穴盘单位面积内的穴格数目越少，影响单位面积的产量，价格或成本会增加。穴盘的规格有288目、 200目、128目或50目，主要视育苗时间的长短、根系深浅和商品苗（移植苗）的规格来确定。对使用过的穴盘，再次使用前必须消毒，常用方法是600倍液多菌灵，800～1000倍液杀灭尔等杀菌剂洗刷或喷洒，之后用清水冲洗2～3次。
　　将混合好的基质填装穴盘，可机械操作，也可人工填装。注意尽量使每个穴孔填装均匀，并轻轻镇压，使基质中间略低于四周。基质不可填装过满，应略低于穴盘孔的高度，使每个穴孔的轮廓清晰可见。播种前一天应淋湿基质，达到刚好浇透的程度，即穴孔底部有水渗出的程度。淋湿的方法采用自动间歇喷水或手工多遍喷水的方式，让水分缓慢渗透基质。
　　穴盘育苗一般是每个穴孔放一粒种子，无论是机械播种还是人工播种都要力求种子落在穴孔正中。播种后较大粒种子要覆一层基质（蛭石等），小粒种子可不覆土。
　　环境控制
　　从附表不难看出，穴盘育苗需要在一定的环境条件下完成，如温度、湿度（浇水）、光照、肥料等。如是严格地按照戴维的方法，最好在专门的育苗室（发芽室）内进行，借助各种控制条件和检测仪器使其在标准状态发芽、发育。对于大型、专业化的生产企业来说，也确实需要这样的育苗室（发芽室）。对于一般的生产企业来说，也需要有可调温的温室，这样可以满足各种目标花期的需要。
　　温度温度是决定育苗的首要环境条件。当温室的温度低于发芽温度时需要进行加热，加热方式有空气加热和基质加热，空气加热如燃油暖风机加热、水暖管道加热等；基质加热如地热线加热等。如温室内温度太高，可选湿帘风机降温系统进行降温，如果温度差别在2℃～3℃范围内可使用温室的其它系统如遮荫、通风、喷雾等系统和装置帮助降温，这样可以节约生产成本。但最大的问题是，从第一阶段到第四阶段是温度下降的要求，如果背离了季节的变化、光靠强制性的温度调节的话，容易造成成本上升，所以一定要根据季节的变化合理安排生产。
　　湿度合理的湿度和适当的喷淋措施是培育健壮花苗的关键，从相对湿度接近100%的第一阶段，到基质见干见湿、只要不出现萎蔫现象就尽量少浇水的第四阶段，也决定了湿度和水分的管理是一个复杂的过程。正确地把握幼苗生产的四个阶段并逐步减少基质的含水量是一项重要的管理内容，及时调整自动喷淋（雾）的次数和时间就能控制湿度和水分。蒸发量小，空气湿度大时少喷水，相反，就要多喷水，下午喷最后一遍水时要保证夜间叶面无水珠。
　　光照不同的花卉对光照要求不一样。金盏菊要求在光照条件下发芽，仙客来要求在黑暗中发芽，大多数花卉种子是在这两者之间，即在一般自然条件下就可以发芽。但第二阶段以后必须见光，结合温度的情况，可以适当遮荫，遮荫程度从40%～60%不等，要根据不同种子的生态特性来决定，大岩桐和四季海棠要求的遮阳强一些，一串红、鸡冠花可完全不遮荫，瓜叶菊遮去30%左右的阳光就可以。随着各阶段的递进需要的光照逐步增强，这是一条基本的规律。
　　施肥在种子育苗的基质中，基本没有肥料或只有很少的肥料，这就使育苗后的施肥显得尤为重要。一般种子从第三阶段就一定要施肥，但有些种子从第二阶段就必须施肥，否则就会大大延长育苗的时间，像四季海棠和瓜叶菊就属于这一类型。这其中的规律可以认同为第二阶段较长的种子需要施肥。其施肥的量是从低浓度向高浓度逐渐增加的。以氮肥浓度为标准可从100ppm开始，每周增加50～100ppm，视花苗的长势和叶色来判断幼苗对肥料的需要量。使用穴盘育苗最好使用液体肥料，这样比较容易控制其浓度，如条件不允许也可以使用缓效控施肥，切忌使用带有挥发性的氮肥，以免对幼苗造成伤害。